Добро пожаловать в Батайский лечебно-диагностический центр!

Мы открыты : Пн-Пт 8:00-20:00 Сб-Вс 8:00-17:00
  Телефон : +79613308049

Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Диагностика

Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Диагностика
Авторы:
Angela M Caliendo, MD, PhD
Кимберли Э. Хэнсон, доктор медицины, MHS
Редактор раздела:
Мартин С. Хирш, доктор медицины
Заместитель редактора:
Эллисон Блум, доктор медицины
Все темы обновляются по мере появления новых доказательств и завершения нашего процесса экспертной оценки .
Обзор литературы до:  июль 2020 г. | Последнее обновление этой темы:  25 августа 2020 г.

ВВЕДЕНИЕКоронавирусы – важные патогены человека и животных. В конце 2019 года новый коронавирус был идентифицирован как причина кластера случаев пневмонии в Ухане, городе в китайской провинции Хубэй. Он быстро распространился, что привело к эпидемии по всему Китаю, за которой последовало увеличение числа случаев заболевания в других странах по всему миру. В феврале 2020 года Всемирная организация здравоохранения обозначила заболевание как COVID-19, что означает коронавирусную болезнь 2019 года [ 1 ]. Вирус, вызывающий COVID-19, обозначен как коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2); ранее он назывался 2019-nCoV.

Понимание COVID-19 постоянно развивается. Временное руководство было выпущено Всемирной организацией здравоохранения и Центрами США по контролю и профилактике заболеваний [ 2,3 ]. Ссылки на эти и другие руководящие принципы общества можно найти в другом месте. (См. «Ссылки на правила общества» ниже.)

В этой теме пойдет речь о диагностике COVID-19. Клинические особенности, эпидемиология, вирусология и профилактика COVID-19 обсуждаются в другом месте. (См. «Коронавирусное заболевание 2019 г. (COVID-19): клинические признаки» и «Коронавирусное заболевание 2019 г. (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика» .)

Управление COVID-19 также подробно обсуждается в другом месте:

(См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Амбулаторная оценка и ведение взрослых» .)

(См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Ведение госпитализированных взрослых» .)

(См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в здравоохранении и в домашних условиях» .)

Вопросы, связанные с COVID-19 у беременных женщин и детей, обсуждаются в другом месте:

(См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Проблемы с беременностью» .)

(См. «Коронавирусное заболевание 2019 г. (COVID-19): Клинические проявления и диагностика у детей» и «Коронавирусное заболевание 2019 г. (COVID-19): мультисистемный воспалительный синдром у детей» .)

См. Обзоры по конкретным темам для получения подробной информации об осложнениях COVID-19 и проблемах, связанных с COVID-19, у других групп пациентов.

Отдельно обсуждаются коронавирусы простуды, коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS) и коронавирус ближневосточного респираторного синдрома (MERS). (См. «Коронавирусы» и «Тяжелый острый респираторный синдром (SARS)» и «Коронавирус ближневосточного респираторного синдрома: вирусология, патогенез и эпидемиология» .)

ДИАГНОСТИЧЕСКИЙ ПОДХОД

Клиническое подозрение  –  Возможность COVID-19 следует рассматривать в первую очередь у больных с впервые выявленной лихорадкой и / или симптомами дыхательных путей (например, кашель, одышка). Его также следует рассматривать у пациентов с тяжелыми заболеваниями нижних дыхательных путей без какой-либо явной причины. Другие постоянные симптомы включают миалгию, диарею и нарушения запаха или вкуса ( таблица 1 ) (см. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): клинические особенности», раздел «Первоначальное проявление» ). Хотя эти синдромы могут возникать при других респираторных вирусных заболеваниях, вероятность COVID-19 увеличивается, если пациент:

Проживает или путешествовал в течение предшествующих 14 дней в место, где в сообществе наблюдается передача тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2; т. Е. Большое количество случаев, которые не могут быть связаны с конкретными цепочками передачи); в таких местах проживание в местах скопления людей или связь с событиями, о которых были зарегистрированы группы случаев, представляют собой особенно высокий риск заражения. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Географическое распространение и количество случаев» и «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел о «Риск передачи зависит от типа воздействия» .)

или

За последние 14 дней имел тесный контакт с подтвержденным или подозреваемым случаем COVID-19, в том числе по работе в медицинских учреждениях. Тесный контакт включает нахождение на расстоянии примерно шести футов (около двух метров) от человека с COVID-19 более нескольких минут без использования средств индивидуальной защиты (СИЗ) или непосредственный контакт с инфекционными выделениями без использования СИЗ.

Хотя нет конкретных клинических признаков, которые могли бы надежно отличить COVID-19 от других вирусных респираторных инфекций, некоторые особенности могут вызывать более высокий уровень клинического подозрения. Развитие одышки через несколько дней после появления первых симптомов указывает на COVID-19 [ 4 ]. В одном исследовании медицинских работников (в основном женщин в возрасте от 20 до 40 лет), которые были протестированы на SARS-CoV-2 из-за постоянных легких симптомов, аносмия и миалгии были наиболее тесно связаны с положительным результатом теста [ 5 ]. Другие, более необычные находки, такие как впервые возникшие ознобитые поражения (например, «пальцы ног COVID»), также усиливают подозрение на COVID-19. Однако ни один из этих результатов не устанавливает окончательного диагноза COVID-19 без микробиологического тестирования.

COVID-19 также должен рассматриваться в диагностике у пациентов с внелегочными осложнениями, связанными с инфекцией SARS-CoV-2, включая повреждение сердца, ишемический инсульт и другие тромбоэмболические события, а также воспалительные осложнения (например, мультисистемный воспалительный синдром в дети). (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Клинические особенности», раздел «Течение и осложнения» .)

Пациентам с подозрением на COVID-19, которые не нуждаются в неотложной помощи, следует рекомендовать позвонить до обращения в медицинское учреждение для обследования. Многие пациенты могут быть оценены относительно необходимости тестирования по телефону. Для пациентов в медицинском учреждении меры инфекционного контроля следует применять, как только появляется подозрение на возможность COVID-19. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Пациенты с подозрением или подтвержденным COVID-19» .)

Кого тестировать

Пациенты с симптомами  – по  возможности, все пациенты с симптомами и подозрением на инфекцию (см. «Клинические подозрения» выше) должны пройти тестирование; окончательный диагноз нельзя поставить без микробиологического исследования. Однако ограниченные возможности могут помешать тестированию всех пациентов с подозрением на COVID-19. У местных отделов здравоохранения могут быть определенные критерии для тестирования.

В инфекционной Общество Америки (IDSA) предложил приоритеты для тестирования при тестировании емкости ограничено ( таблица 2 ); к высокоприоритетным лицам относятся госпитализированные пациенты (особенно тяжелобольные с необъяснимым респираторным заболеванием) и лица с симптомами, которые являются медицинскими работниками или службами первой помощи, работают или проживают в условиях коллективного проживания или имеют факторы риска тяжелого заболевания [ 6 ].

Европейский центр профилактики и контроля заболеваний также предложил стратегии тестирования, когда ресурсы тестирования ограничены.

Критерии тестирования, предложенные Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ), можно найти в ее техническом руководстве в Интернете .

Во многих случаях из-за ограниченной доступности тестов диагноз COVID-19 устанавливается предположительно на основе сопоставимых клинических проявлений в условиях риска воздействия, особенно когда нет очевидной другой причины симптомов. Ведение подозреваемых случаев, когда тестирование недоступно, обсуждается в другом месте. (См. Раздел «Тестирование на COVID-19 недоступно» ниже.)

Выберите бессимптомных людей  –  тестирование некоторых бессимптомных людей также может иметь важное значение для общественного здравоохранения или целей инфекционного контроля. Возможные показания для тестирования бессимптомных лиц включают [ 7,8 ]:

Раннее выявление инфекции в местах скопления людей, в которых содержатся лица, подверженные риску тяжелого заболевания (например, учреждения длительного ухода, исправительные учреждения и места содержания под стражей, приюты для бездомных). Это включает тестирование в ответ на выявленные случаи COVID-19 в учреждении, а также периодический скрининг сотрудников и жителей. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Учреждения длительного ухода» .)

Скрининг госпитализированных пациентов в местах с высокой распространенностью (например, положительный результат ПЦР ≥10% в сообществе).

До срочных хирургических процедур или процедур, связанных с образованием аэрозолей.

До приема иммуносупрессивной терапии (в том числе до трансплантации) [ 8,9 ]. (См. «Коронавирусное заболевание 2019 (COVID-19): вопросы, связанные с трансплантацией твердых органов», раздел «Предтрансплантационный скрининг» .)

После тесного контакта с человеком с COVID-19 (включая новорожденных, рожденных от матерей с COVID-19). Однако время до обнаружения РНК после воздействия неизвестно, поэтому оптимальное время для тестирования на COVID-19 после воздействия неизвестно; Рекомендуется от пяти до семи дней после контакта, исходя из среднего инкубационного периода [ 6 ]. Даже если контактный человек дал отрицательный результат теста на вирус после контакта, в большинстве случаев рекомендуется карантин [ 10 ]. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Ведение бессимптомных лиц с потенциальным воздействием» .)

В Соединенных Штатах Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) предлагают не проводить повторное тестирование бессимптомных лиц, которым ранее был поставлен диагноз SARS-CoV-2 в течение предшествующих трех месяцев из-за низкой вероятности того, что повторный положительный тест в течение этого интервала времени представляет собой активное повторное заражение. (См. «Устойчивый или повторяющийся положительный результат NAAT» ниже.)

Первоначальное тестирование и сбор образцов  –  тестирование амплификации нуклеиновых кислот (NAAT), чаще всего с использованием анализа полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR), для обнаружения РНК SARS-CoV-2 из верхних дыхательных путей является предпочтительным начальным диагностическим тестом для COVID-19 [ 11 ]. В некоторых условиях первоначальным тестом может быть тестирование на антиген, но чувствительность тестов на антиген ниже, чем у NAAT, и отрицательные тесты на антигены должны подтверждаться тестом NAAT.

Образцы верхних дыхательных путей являются основными образцами для SARS-CoV-2 NAAT. В США CDC рекомендует собрать один из следующих образцов [ 12 ]:

Образец мазка из носоглотки, взятый врачом

Образец мазка из носа из обоих передних носовых ходов, взятый врачом или пациентом на месте или дома

Промывание / аспират носа или носоглотки, полученное врачом.

Образец мазка из ротоглотки, взятый врачом.

Тем не менее, нет уверенности в выборе оптимального образца из верхних дыхательных путей. IDSA предлагает образцы из носоглотки, средней носовой раковины или носа, а не образцы из ротоглотки (или слюны) из-за ограниченных данных, предполагающих более низкую чувствительность образцов из ротоглотки [ 8 ]. Однако последующие исследования показали, что образцы слюны выгодно отличаются от образцов из носа, а в Соединенных Штатах несколько анализов на основе слюны получили разрешение на экстренное использование. Чувствительность теста с разными образцами обсуждается в другом месте. (См. «Точность» ниже.)

Дополнительную информацию о тестировании и обращении с клиническими образцами можно найти на веб-сайте CDC.

Практика инфекционного контроля во время сбора образцов обсуждается в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Пациенты с подозрением или подтвержденным COVID-19» .)

Интерпретация теста и дополнительное тестирование

Положительный результат NAAT  –  положительный тест на амплификацию нуклеиновых кислот (NAAT; например, RT-PCR) для SARS-CoV-2 обычно подтверждает диагноз COVID-19. Никаких дополнительных диагностических исследований не требуется. Однако для лечения госпитализированных пациентов может потребоваться дополнительное тестирование. Это обсуждается в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Ведение госпитализированных взрослых», раздел «Оценка» .)

Пациенты с COVID-19 могут иметь детектируемую РНК SARS-CoV-2 в образцах из верхних дыхательных путей в течение нескольких недель после появления симптомов [ 13 ]; однако длительное обнаружение вирусной РНК не обязательно указывает на продолжающуюся инфекционность [ 14,15 ]. Эти данные и последствия отмены мер предосторожности подробно обсуждаются в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Выделение вируса и период заразности» и «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в здравоохранении и домашних условиях») , раздел «Прекращение применения мер предосторожности» .)

Также были сообщения о пациентах с COVID-19, у которых были положительные тесты NAAT после документально подтвержденного клиренса вирусной РНК. Пока нет доказательств того, что это открытие представляет рецидив или повторную инфекцию. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Иммунитет и риск повторного заражения» .)

Отрицательный результат NAAT  –  для многих людей одного отрицательного результата NAAT достаточно, чтобы исключить диагноз COVID-19. Однако ложноотрицательные тесты NAAT (например, ОТ-ПЦР) из образцов из верхних дыхательных путей были хорошо задокументированы (см. «Точность» ниже). Если первоначальный анализ отрицательный, но подозрение на COVID-19 остается (например, симптомы, наводящие на мысль без очевидной альтернативной причины) и подтверждение наличия инфекции важно для лечения или инфекционного контроля, мы предлагаем повторить тест. Оптимальные сроки для повторного тестирования неизвестны; обычно его проводят через 24–48 часов после первоначального теста. Повторять тестирование в течение 24 часов не рекомендуется.

У пациентов с признаками заболевания нижних дыхательных путей образцы из нижних дыхательных путей могут быть вариантом для тестирования NAAT [ 8,16 ]. Мы согласны с рекомендациями IDSA по резервированию анализа NAAT образца нижних дыхательных путей для госпитализированных пациентов, у которых есть первоначальный отрицательный результат теста на образец из верхних дыхательных путей, но у которых сохраняется подозрение на инфекцию SARS-CoV-2 нижних дыхательных путей [ 8]. Для образцов из нижних дыхательных путей следует собрать отхаркивающую мокроту у пациентов с продуктивным кашлем, а аспират трахеи или бронхоальвеолярный лаваж – у интубированных пациентов. Большинство NAAT не получили разрешения на экстренное использование образцов нижних дыхательных путей, поэтому лабораториям необходимо проверять эти типы образцов, а это может быть невозможно для всех лабораторий. Не рекомендуется отведение мокроты.

У госпитализированных пациентов с подозрением на COVID-19, у которых есть отрицательный результат SARS-CoV-2 NAAT, характерные лабораторные данные или результаты визуализации могут дополнительно подтвердить клинический диагноз COVID-19 и быть причинами для соблюдения мер инфекционного контроля (см. «Коронавирусная болезнь 2019 ( COVID-19): Клинические особенности », раздел« Результаты лабораторных исследований » и « Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Клинические особенности », раздел« Результаты визуализации » ). Также важно учитывать другие потенциальные причины симптомов у пациентов с отрицательными NAAT SARS-CoV-2.

Для пациентов, у которых заболевание наблюдается через три-четыре недели и у которых NAAT отрицательный, проверка серологического теста может быть информативной [ 17,18 ]. Если серологическое исследование проводится в этих условиях, мы предлагаем тест на IgG; также, вероятно, будет полезен общий тест на антитела, но данные для этой ситуации ограничены. Реактивный IgG может указывать на COVID-19, тогда как отрицательный тест может указывать на снижение вероятности. Однако надежность результата серологического теста зависит от конкретного теста и продолжительности заболевания. (См. Раздел «Серология для выявления предшествующей / поздней инфекции» ниже.)

Меры по контролю за инфекцией COVID-19 следует продолжать, пока проводится повторная оценка. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Пациенты с подозрением или подтвержденным COVID-19» .)

Во многих случаях из-за ограниченной доступности тестов и опасений по поводу ложноотрицательных результатов диагноз COVID-19 устанавливается предположительно на основе сопоставимых клинических проявлений в условиях риска заражения (проживание в районе или поездка в район с широко распространенная передача в сообществе или известный контакт) при отсутствии других идентифицируемых причин.

Неопределенный результат NAAT  –  Интерпретация неубедительного или неопределенного результата зависит от конкретного проведенного теста амплификации нуклеиновых кислот (NAAT); Клиницист должен посоветоваться с лабораторией-исполнителем о дополнительных исследованиях.

В некоторых случаях неубедительный или неопределенный результат указывает на то, что был идентифицирован только один из двух или более генов, являющихся мишенями теста NAAT. Эти результаты можно рассматривать как предполагаемые положительные, учитывая высокую специфичность анализов NAAT. Если пациент находится на ранней стадии заболевания, для подтверждения может оказаться полезным повторное обследование.

Тестирование других патогенов  –  Если грипп и респираторно – синцитиальный вирус (RSV) циркулируют в обществе, разумно также испытание для этих вирусов при проверке SARS-CoV-2, так как это может иметь последствия для управления.

Однако обнаружение другого вирусного (или бактериального) патогена не обязательно исключает SARS-CoV-2 в местах, где широко распространена передача. Была описана коинфекция SARS-CoV-2 и другими респираторными вирусами, включая грипп, но сообщаемая частота варьируется [ 19–22 ].

СПЕЦИАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ

NAAT (включая RT-PCR) для диагностики текущей инфекции

Типы NAAT  –  Диагноз COVID-19 ставится в первую очередь путем прямого обнаружения РНК коронавируса 2 (SARS-CoV-2) тяжелого острого респираторного синдрома с помощью тестов амплификации нуклеиновых кислот (NAAT), чаще всего полимеразной цепной реакции обратной транскрипции (RT -ПЦР) из верхних дыхательных путей ( таблица 3 ) [ 11,23 ]. Во всем мире используются различные анализы ОТ-ПЦР; различные анализы амплифицируют и обнаруживают разные области генома SARS-CoV-2. Некоторые нацелены на два или более гена, включая гены нуклеокапсида (N), оболочки (E) и шипа (S), а также области в первой открытой рамке считывания, включая ген РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp) [ 24]. Другие, менее распространенные типы NAAT включают изотермическую амплификацию, анализы на основе CRISPR и секвенирование следующего поколения.

В Соединенных Штатах Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) выдало разрешение на экстренное использование для многих различных анализов NAAT [ 25 ]; тестирование проводится Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC), местными отделами здравоохранения, больничными лабораториями и некоторыми коммерческими справочными лабораториями. Для некоторых анализов пациент может собрать образец дома и отправить его в лабораторию [ 26,27 ]. Эти тесты имеют разные рабочие характеристики и время получения результатов (от 15 минут до нескольких часов) и разрешены для разных типов образцов. Время, необходимое клиницистам для получения результата, также зависит от того, как часто лаборатория проводит тест.

Объединенное тестирование образцов с помощью NAAT (т. Е. Тестирование нескольких образцов вместе и повторное тестирование отдельных образцов только в случае положительного результата теста пула) может улучшить лабораторные возможности тестирования [ 28–31 ]. Однако такой подход не сэкономит время и ресурсы в условиях высокой распространенности, поскольку частое повторное тестирование пулов с положительным результатом теста является обременительным; таким образом, его лучше всего использовать для групп населения с ожидаемой низкой распространенностью, таких как бессимптомные люди без известного воздействия. Клиницисты должны знать, что объединение образцов снижает чувствительность теста (в большей степени при большом размере пула) и может продлить время до индивидуального положительного результата.

Также были разработаны NAAT в местах оказания медицинской помощи, хотя некоторые из них менее чувствительны, чем лабораторные тесты [ 32 ].

Точность  –  Точность и прогностические значения NAAT SARS-CoV-2 систематически не оценивались. Это высокоспецифичные тесты [ 33,34 ]. Хотя NAAT обладают высокой аналитической чувствительностью в идеальных условиях (т. Е. Они способны точно определять низкие уровни вирусной РНК в тестируемых образцах, которые, как известно, содержат вирусную РНК), клиническая эффективность более вариабельна ( таблица 3 ).

Ложноположительные результаты редки, но сообщалось о некоторых платформах [ 35 ].

Зарегистрированные ложноотрицательные показатели колеблются от менее 5 до 40 процентов, хотя эти оценки ограничены, отчасти потому, что не существует идеального эталона для сравнения [ 36,37 ]. Например, в исследовании 51 пациента, который был госпитализирован в Китае с лихорадкой или острыми респираторными симптомами и в конечном итоге имел положительный результат ОТ-ПЦР на SARS-CoV-2 (в основном на мазках из горла), 15 пациентов (29 процентов) имели отрицательный исходный тест и только был диагностирован путем серийного тестирования [ 38 ]. В аналогичном исследовании 70 пациентов в Сингапуре первоначальное назофарингеальное тестирование было отрицательным у 8 пациентов (11 процентов) [ 39]. В обоих исследованиях у редких пациентов были неоднократные отрицательные результаты и положительные результаты только после четырех или более тестов. Однако были также предложены более низкие уровни ложноотрицательных результатов. В одном исследовании 626 пациентов, у которых был повторный тест носоглоточной RT-PCR в течение семи дней после первоначального отрицательного теста в двух крупных медицинских центрах в США, 3,5 процента повторных тестов были положительными [ 37 ].

Чувствительность теста, вероятно, зависит от типа и качества полученного образца, продолжительности заболевания на момент тестирования и конкретного анализа:

Проведение теста в зависимости от типа образца – данные, сравнивающие точность тестирования из разных мест, ограничены, но предполагают, что чувствительность теста может варьироваться в зависимости от типа образца. Образцы из нижних дыхательных путей могут иметь более высокую вирусную нагрузку и с большей вероятностью дадут положительный результат, чем образцы из верхних дыхательных путей [ 40,41 ]. В исследовании 205 пациентов с COVID-19, образцы которых были взяты из разных мест, самые высокие показатели положительных результатов тестов на вирусную РНК были зарегистрированы при бронхоальвеолярном лаваже (95 процентов, 14 из 15 образцов) и мокроте (72 процента, 72 из 104 образцов). по сравнению с мазком из ротоглотки (32%, 126 из 398 образцов) [ 40 ].

Некоторые исследования показали, что уровни вирусной РНК выше и чаще обнаруживаются в носовых пробах по сравнению с пероральными образцами [ 40,42 ]. Например, в одном исследовании, в котором 117 пар образцов из носоглотки и ротоглотки были протестированы одновременно, 32 пары оказались несовместимыми с одним положительным и другим отрицательным тестом; образец из носоглотки дал положительный результат в 66% этих пар по сравнению с 34% для образца из ротоглотки [ 42 ]. Однако другие исследования не выявили более высоких уровней вирусной РНК в носоглотке по сравнению с образцами из ротоглотки [ 14 ].

Самостоятельный сбор образцов может снизить потребность в средствах индивидуальной защиты, поскольку поставщик медицинских услуг не занимается сбором образцов напрямую. Точность NAAT, по-видимому, относительно высокая для некоторых образцов, собранных самостоятельно (например, мазков из носа и образцов слюны). Чувствительность NAAT с образцами из носа или средней носовой раковины, собранными самостоятельно, может быть аналогична чувствительности к образцам из носоглотки, собранным врачом [ 43,44 ]. В исследовании, сравнивающем эффективность ОТ-ПЦР для этих разных образцов от примерно 500 пациентов, чувствительность образцов из носа и средней носовой раковины по сравнению с таковой из носоглотки составила 94 и 96 процентов соответственно [ 43]. Несколько исследований показали, что относительная чувствительность собранных самостоятельно образцов слюны по сравнению с образцами из носоглотки составляет 85 процентов и выше; оптимальный метод сбора слюны неизвестен, и инструкции по сбору в этих исследованиях различались [ 45-50 ].

Выполнение теста в зависимости от продолжительности заболевания. Вероятность обнаружения РНК SARS-CoV-2 также может варьироваться в зависимости от продолжительности заболевания [ 51,52 ]. При анализе семи исследований (включая два неопубликованных отчета), в которых оценивалась эффективность ОТ-ПЦР по времени с момента появления симптомов или воздействия, расчетная частота ложноотрицательных результатов составила 100% в день воздействия, 38% на 5-й день (оценка в первый день симптомов), 20 процентов на 8 день и 66 процентов на 21 день [ 51]. Неоднородность исследований и предположения, сделанные при анализе (например, относительно инкубационного периода и времени воздействия), снижают уверенность в этих результатах. Одно из исследований, включенных в анализ, использовало комбинацию ОТ-ПЦР и серологического теста на IgM для постановки диагноза COVID-19 и показало, что отрицательные показатели ОТ-ПЦР были <10% в дни с 1 по 3 болезни,> 20 процентов на 6-й день и> 50 процентов на 14-й день; однако эти результаты также следует интерпретировать с осторожностью, поскольку используемый серологический тест не был валидирован для выявления острой инфекции, а тесты IgM часто бывают ложноположительными [ 52 ]. Другие исследования также показали, что уровни вирусной РНК высоки до развития симптомов (т. Е. У пре-симптоматических пациентов) [ 53 ]. (Видеть«Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Выделение вирусов и период инфекционности» .)

Данные о выполнении тестов и уровнях вирусной РНК у бессимптомных пациентов ограничены [ 53 ]. Неизвестно, как скоро вирусная РНК может быть обнаружена после заражения и заражения.

Производительность тестов в зависимости от типа анализа. Существуют также различия в пределах обнаружения среди основных коммерческих анализов NAAT, и повторное тестирование образцов на разных платформах может дать противоречивые результаты [ 33,34 ]. Кроме того, анализы NAAT в месте оказания медицинской помощи могут быть не такими чувствительными, как лабораторные [ 32 ].

Порог цикла  –  порогового цикла (Ct) относится к числу циклов в анализе ОТ-ПЦР , необходимых для амплификации вирусной РНК для достижения детектируемого уровня. Таким образом, значение Ct может указывать на относительный уровень вирусной РНК в образце (при этом более низкие значения Ct отражают более высокие вирусные уровни). Полученные лаборатории обычно не предоставляют значение Ct с качественным результатом NAAT, хотя его можно получить по запросу для некоторых платформ тестирования. Однако клиническое применение КТ не определено. Значения Ct не стандартизированы для платформ ОТ-ПЦР, поэтому результаты нельзя сравнивать в разных тестах. Более того, никакие клинические исследования не подтвердили использование КТ в качестве руководства.

Тестирование на антиген как альтернатива NAAT  –  тесты, которые обнаруживают антиген SARS-CoV-2, могут выполняться быстро и по месту оказания медицинской помощи и, таким образом, могут быть более доступными с более быстрым временем получения результатов, чем некоторые NAAT. Однако данные об эффективности тестов на антиген для SARS-CoV-2 ограничены, и они, как правило, менее чувствительны, чем NAAT ( таблица 3 ). Клиницисты должны знать о возможности получения ложноотрицательных результатов тестов на антигены; отрицательный результат теста на антиген не исключает заражения SARS-CoV-2. Отрицательные результаты теста на антиген следует подтверждать с помощью чувствительного NAAT, если клиническое подозрение велико [ 54 ].

Несмотря на то, что он не может обнаружить вирус на таких низких уровнях, как NAAT, тестирование на антиген может быть полезным для людей, которые находятся на ранних стадиях инфекции, когда репликация вируса находится на самом высоком уровне. Это также может быть полезно для повторного скрининга людей в местах скопления людей с высоким риском для выявления людей с SARS-CoV-2 и их изоляции; Моделирование исследований показало, что если частота тестирования достаточно высока, даже тесты с более низкой чувствительностью могут быть успешно использованы для снижения совокупного уровня инфицирования [ 55 ].

Некоторые производители продают экспресс-тесты на антигены в месте оказания медицинской помощи, а в Соединенных Штатах FDA выдало разрешения на экстренное использование некоторых тестов на антигены, которые проводятся с использованием мазков из носа [ 56 ].

Серологический анализ для выявления предшествующей / поздней инфекции  –  серологические тесты обнаруживают в крови антитела к SARS-CoV-2, а те, которые были надлежащим образом валидированы, могут помочь идентифицировать пациентов, у которых ранее была инфекция SARS-CoV-2, а также пациентов с текущей инфекцией, которые симптомы проявлялись в течение трех-четырех недель ( таблица 3 ). Поскольку серологические тесты с меньшей вероятностью будут реактивными в первые несколько дней или недель после инфицирования, они имеют очень ограниченную полезность для диагностики в острых условиях [ 23,57,58 ]. Проверка серологии через три-четыре недели после появления симптомов оптимизирует точность тестирования, поскольку чувствительность теста после пяти недель является неопределенной [ 18 ].

Мы предлагаем использовать тесты на антитела IgG или общие антитела, а не тесты на антитело IgM, антитело IgA или тесты дифференциации IgM / IgG из-за их большей точности; это соответствует рекомендациям Американского общества инфекционистов (IDSA) [ 18 ]. Чтобы максимизировать прогностическую ценность серологического теста, следует использовать тесты с высокой специфичностью (≥99,5 процента), а тестирование должно быть зарезервировано для лиц с высокой вероятностью предшествующей инфекции перед тестированием; CDC также предлагает альтернативную стратегию использования двухэтапного алгоритма тестирования, в котором первоначальный положительный результат подтверждается вторым, другим анализом антител [ 57]. В областях с низкой распространенностью серологии или низкой вероятностью заражения до проведения теста индивидуальные результаты следует интерпретировать с осторожностью, поскольку в этих условиях даже серологические тесты с высокой специфичностью все равно имеют низкую прогностическую ценность положительного результата (т. Е. Положительный результат теста может быть столь же вероятным. отражать ложное срабатывание как истинное срабатывание) [ 59 ].

В США несколько серологических тестов получили разрешение FDA на экстренное использование [ 25 ]. Это тесты на связывающие антитела, которые выявляют антигены SARS-CoV-2 (нуклеокапсид или спайк-белок) и включают тесты, которые можно проводить в месте оказания медицинской помощи, и тесты, требующие специализированного оборудования и обученного лабораторного персонала. Чувствительность и специфичность многих из этих серологических тестов неизвестны; каталог этих тестов можно найти на сайте centerforhealthsecurity.org . FDA также независимо оценивает точность определенных серологических тестов на COVID-19 и публикует результаты на своем веб-сайте .

Для развития детектируемых антител обычно требуется от нескольких дней до недель, а время до обнаружения антител зависит от теста [ 52,60-62 ]. В систематическом обзоре 38 исследований, в которых оценивалась чувствительность серологического тестирования по времени с момента появления симптомов у пациентов с COVID-19, IgM был обнаружен в 23 процентах случаев через одну неделю, в 58 процентах через две недели и в 75 процентах через три недели. ; соответствующие уровни обнаружения для IgG составляли 30, 66 и 88 процентов [ 63 ]. Другие исследования показали, что процент положительных IgG приближается к 100 процентам к 16–20 дням [ 17,64,65 ].

Однако в этих исследованиях использовались различные серологические тесты, в том числе тесты, разработанные в собственной лаборатории, и их чувствительность в разные сроки существенно различается. В частности, некоторые анализы латерального потока (которые используются для тестов на месте) менее чувствительны, чем иммуноферментные анализы или хемилюминесцентные иммуноанализы [ 66 ].

Специфичность также зависит от типа серологического анализа. В отличие от тестов на антитела IgG и общих антител, тесты на антитела IgM, антитела IgA и тесты дифференциации IgM / IgG обычно имеют специфичность ниже 99 процентов [ 18 ]. Перекрестная реактивность с другими коронавирусами и другими вирусными патогенами является потенциальной проблемой [ 67 ].

Продолжительность обнаружения антител неизвестна [ 68,69 ]. В одном исследовании было отмечено, что уровни IgG снижаются в среднем примерно на 75 процентов от острой фазы до ранней стадии выздоровления, а через восемь недель после заражения у 40 процентов бессимптомных пациентов и 13 процентов симптомных пациентов не обнаруживались IgG. [ 68 ].

Широкомасштабный серологический скрининг с использованием проверенных тестов может помочь лучше измерить активность заболевания (путем выявления людей, которым не был поставлен диагноз ОТ-ПЦР или у которых могла быть бессимптомная или субклиническая инфекция), а также выявить лиц, у которых может быть иммунитет к инфекция; серологические корреляты защитного иммунитета, однако, не определены. До тех пор, пока не будут получены дополнительные данные, CDC рекомендует не использовать результаты тестирования на антитела для определения условий проживания в местах скопления людей, таких как общежития или тюрьмы, принятия решений о возвращении к работе или изменения требований к работе и средствам индивидуальной защиты для медицинских работников и первые респонденты [ 57 ]. (Видеть«Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Выделение вируса и период заразности» и «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел « Иммунитет и риск повторного заражения » .)

Другие тесты

Вирусный посев – по соображениям безопасности образцы от пациента с подозрением на COVID-19 не следует отправлять в клинические лаборатории для вирусного посева Вирусная культура в основном предназначена для исследовательских целей. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Выделение вирусов и период инфекционности» .)

ОСОБЫЕ СИТУАЦИИ

Тестирование на COVID-19 недоступно  –  в некоторых ситуациях тестирование на COVID-19 может быть недоступно, особенно для людей, которые имеют совместимое, но легкое заболевание, которое не требует госпитализации, и у которых нет известного контакта с COVID-19 или высокого уровня -рисковая история путешествий.

В Соединенных Штатах существует ограниченное официальное руководство для этой ситуации, и подход может зависеть от распространенности COVID-19 в этом районе. Если у клинициста есть достаточные опасения по поводу возможного COVID-19 (например, существует передача инфекции в сообществе и нет другой очевидной причины для симптомов), разумно предположить, что у пациента был COVID-19, и посоветовать пациенту самоизолироваться в домой (если госпитализация не требуется) и предупредить врача об ухудшении симптомов. Амбулаторное лечение COVID-19 подробно обсуждается в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Амбулаторная оценка и ведение взрослых», раздел «Ведение и консультирование для всех амбулаторных пациентов» и«Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Инфекционный контроль в домашних условиях» .)

Прекращение применения мер предосторожности  –  тестирование для определения продолжительности мер предосторожности по инфекционному контролю у пациентов с известным COVID-19 подробно обсуждается в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских и домашних условиях», раздел «Прекращение мер предосторожности» .)

Стойкие или рецидивирующий положительным NAAT  –  Пациенты с диагнозом COVID-19 может быть обнаружено тяжелого острого респираторного синдрома коронавирус 2 (SARS-коронавирус-2) РНК в образцах верхних дыхательных путей в течение нескольких недель после появления симптомов [ 13 ]. Повторно положительные тесты амплификации нуклеиновых кислот (NAAT) после нескольких отрицательных тестов также были хорошо задокументированы у некоторых пациентов с COVID-19.

Однако длительное или повторяющееся обнаружение вирусной РНК не обязательно указывает на длительную инфекционность. Выделение инфекционного вируса из образцов из верхних дыхательных путей более чем через 10 дней после начала болезни редко документировалось у пациентов с нетяжелой инфекцией и симптомы которых исчезли [ 15,70,71 ]. Кроме того, уровни вирусной РНК во время выздоровления, если их можно обнаружить, ниже, чем уровни, обнаруженные во время острого заболевания, и исследования показали, что инфекционный вирус не может быть обнаружен ниже определенного вирусного порога [ 70 ]. Эти данные и последствия отмены мер предосторожности подробно обсуждаются в другом месте. (Видеть«Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел « Выделение вирусов и период заразности» и «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): инфекционный контроль в здравоохранении и домашних условиях», раздел о «Прекращении применения мер предосторожности» .)

Интерпретация положительного результата теста у человека, который выздоровел от лабораторно подтвержденного COVID-19 и снова подвергается NAAT из-за новых симптомов, является неопределенной. Исследования показали, что повторные положительные результаты NAAT вскоре после выздоровления от COVID-19 не означают повторного заражения (см. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): эпидемиология, вирусология и профилактика», раздел «Иммунитет и риск повторного заражения»).). Однако понимание защитного иммунитета к SARS-CoV-2 остается неполным, и не исключена возможность повторного заражения. В Соединенных Штатах Центры по контролю и профилактике заболеваний предлагают рассмотреть возможность повторного заражения, если у пациента есть положительный результат NAAT более чем через три месяца после первоначального заражения, и в таких случаях пациенту следует повторить изоляцию и установить тесные контакты. прослеживаться; положительный результат теста в течение трех месяцев после начала инфекции с меньшей вероятностью отражает повторное инфицирование [ 72 ].

Multisystem воспалительного синдрома у детей  –  Для детей и подростков с подозрением на мультисистемном воспалительный синдром, тестирование на SARS-CoV-2 включает в себя как NAAT и серологического. У многих детей с этим синдромом обнаруживаются антитела к SARS-CoV-2, но тест NAAT отрицательный. Диагностика и оценка мультисистемного воспалительного синдрома обсуждаются в другом месте. (См. «Коронавирусное заболевание 2019 (COVID-19): мультисистемный воспалительный синдром у детей», раздел «Оценка» .)

РУКОВОДСТВО ДЛЯ ОБЩЕСТВАСсылки на общественные и правительственные руководства из отдельных стран и регионов мира предоставляются отдельно. (См. «Ссылки на рекомендации общества: Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19) – Международные руководящие принципы общественного здравоохранения и правительства» и «Ссылки на рекомендации общества: Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19) – Рекомендации по оказанию специализированной помощи» и «Ссылки на рекомендации общества: болезнь 2019 (COVID-19) – Ресурсы для пациентов » .)

ИНФОРМАЦИЯ ДЛЯ ПАЦИЕНТОВUpToDate предлагает два типа учебных материалов для пациентов: «Основы» и «Помимо основ». Пособия по обучению пациентов основам написаны простым языком на уровне чтения с 5- го по 6- й класс и отвечают на четыре или пять ключевых вопросов, которые могут возникнуть у пациента о том или ином состоянии. Эти статьи лучше всего подходят пациентам, которые хотят получить общий обзор и предпочитают короткие, легко читаемые материалы. Обучающие материалы для пациентов Beyond the Basics длиннее, сложнее и детальнее. Эти статьи написаны на уровне чтения с 10- го по 12- й класс и лучше всего подходят для пациентов, которые хотят получить подробную информацию и хорошо владеют медицинским жаргоном.

Вот статьи по обучению пациентов, относящиеся к этой теме. Мы рекомендуем вам распечатать эти темы или отправить их пациентам по электронной почте. (Вы также можете найти статьи по обучению пациентов на самые разные темы, выполнив поиск по «информации о пациенте» и по интересующим ключевым словам.)

Основные темы (см. «Обучение пациентов: обзор коронавирусной болезни 2019 (COVID-19) (Основные сведения)» и «Обучение пациентов: коронавирусная болезнь 2019 г. (COVID-19) и беременность (основы)» и «Обучение пациентов: коронавирусная болезнь 2019 г.» (COVID-19) и дети (Основы) » )

РЕЗЮМЕ И РЕКОМЕНДАЦИИ

Возможность коронавирусного заболевания 2019 (COVID-19) следует рассматривать в первую очередь у пациентов с совместимыми симптомами ( таблица 1 ), в частности, с лихорадкой и / или симптомами респираторного тракта, которые проживают или путешествовали в районы с передачей инфекции в сообществе или которые недавний тесный контакт с подтвержденным или подозреваемым случаем COVID-19. Клиницисты также должны знать о возможности COVID-19 у пациентов с тяжелыми респираторными заболеваниями, когда невозможно установить другую этиологию. (См. Раздел «Клиническое подозрение» выше.)

По возможности, все пациенты с симптомами и подозрением на COVID-19 должны пройти тестирование на коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2). Однако ограничения возможностей тестирования могут препятствовать тестированию всех пациентов с подозрением на инфекцию; Предлагаемые приоритеты включают госпитализированных пациентов и лиц с симптомами, которые являются медицинскими работниками или службами быстрого реагирования, работают или проживают в условиях коллективного проживания или имеют факторы риска тяжелого заболевания ( таблица 2 ). (См. Выше «Кого тестировать» .)

Тест амплификации нуклеиновых кислот (NAAT), чаще всего с использованием анализа полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR), для обнаружения РНК SARS-CoV-2 из верхних дыхательных путей является предпочтительным начальным диагностическим тестом для COVID-19. (См. «Первоначальное тестирование и сбор образцов» выше.)

Положительный результат NAAT на SARS-CoV-2 подтверждает диагноз COVID-19. (См. «Положительный результат NAAT» выше.)

Для многих людей с симптомами одного отрицательного результата NAAT достаточно, чтобы исключить диагноз COVID-19. Однако, если первоначальный анализ отрицательный, но подозрение на COVID-19 остается высоким и подтверждение наличия инфекции важно для лечения или контроля инфекции, мы предлагаем повторить тест. В определенных ситуациях NAAT на образцах нижних дыхательных путей (для госпитализированных пациентов с признаками заболевания нижних дыхательных путей) или серология (для пациентов с симптомами в течение как минимум двух недель) может быть полезным дополнительным диагностическим тестом. (См. «Отрицательный результат NAAT» выше.)

NAAT обнаруживают РНК SARS-CoV-2 в образцах пациентов и обладают высокой специфичностью ( таблица 3 ). Хотя они могут обнаруживать низкие уровни вирусной РНК, чувствительность этих тестов в клинических условиях, вероятно, зависит от типа и качества полученного образца, продолжительности заболевания на момент тестирования и конкретного анализа. По оценкам, количество ложноотрицательных результатов колеблется от менее 5 до 40 процентов. (См. Выше «NAAT (включая ОТ-ПЦР) для диагностики текущей инфекции» .)

Серологические тесты обнаруживают в крови антитела к SARS-CoV-2 и могут помочь идентифицировать пациентов, которые ранее болели COVID-19 ( таблица 3 ). Выявление детектируемых антител обычно занимает от нескольких дней до недель; таким образом, серологические тесты менее полезны для диагностики в острых случаях. Серологические тесты следует использовать с осторожностью из-за различной эффективности среди доступных тестов, потенциальной низкой положительной прогностической ценности в условиях низкой серологической распространенности и неопределенных серологических коррелятов иммунитета. (См. Раздел «Серология для выявления предшествующей / поздней инфекции» выше.)

При подозрении на COVID-19 следует принять меры инфекционного контроля. Инфекционный контроль дома и в медицинских учреждениях подробно обсуждается в другом месте. (См. «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): Инфекционный контроль в медицинских учреждениях и в домашних условиях», раздел «Инфекционный контроль в медицинских учреждениях» .)

Временное руководство было выпущено Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) и Центрами США по контролю и профилактике заболеваний (CDC) , а также другими экспертными организациями. Они обновляются на постоянной основе. Ссылки на эти рекомендации можно найти в другом месте. (См. Раздел «Ссылки на правила общества» выше.)

ССЫЛКИ

  1. Всемирная организация здравоохранения. Выступление Генерального директора на брифинге для СМИ по 2019-nCoV 11 февраля 2020 г. http://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-remarks-at-the-media-briefing -on-2019-ncov-on-11-февраля-2020 (по состоянию на 12 февраля 2020 г.).
  2. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Новый коронавирус 2019 г., Ухань, Китай. Информация для медицинских работников. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/hcp/index.html (по состоянию на 14 февраля 2020 г.).
  3. Всемирная организация здравоохранения. Техническое руководство по новому коронавирусу (2019-nCoV). https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance (по состоянию на 14 февраля 2020 г.).
  4. Коэн PA, Холл LE, Джон JN, Rapoport AB. Ранняя естественная история инфекции SARS-CoV-2: клинические наблюдения из городской амбулаторной клиники COVID-19. Mayo Clin Proc 2020; 95: 1124.
  5. Tostmann A, Bradley J, Bousema T. и др. Сильные ассоциации и умеренная прогностическая ценность ранних симптомов положительности теста на SARS-CoV-2 среди медицинских работников, Нидерланды, март 2020 г. Euro Surveill 2020; 25.
  6. Американское общество инфекционных болезней. COVID-19 Приоритет диагностического тестирования. https://www.idsociety.org/globalassets/idsa/public-health/covid-19-prioritization-of-dx-testing.pdf (по состоянию на 22 марта 2020 г.).
  7. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Обзор тестирования на SARS-CoV-2. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/testing-overview.html (по состоянию на 29 июля 2020 г.).
  8. Руководство Американского общества инфекционных болезней по диагностике COVID-19, 5 мая 2020 г. https://www.idsociety.org/practice-guideline/covid-19-guideline-diagnostics/ (по состоянию на 7 мая 2020 г.).
  9. Европейское общество трансплантации крови и костного мозга. COVID-19 и BMT. https://www.ebmt.org/covid-19-and-bmt (по состоянию на 10 июня 2020 г.).
  10. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Временное руководство по разработке плана расследования случаев COVID-19 и отслеживания контактов. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/case-investigation-contact-tracing.pdf (по состоянию на 19 июня 2020 г.).
  11. Патель А., Jernigan DB, группа реагирования CDC по 2019-nCoV. Первоначальные ответные меры общественного здравоохранения и временные клинические рекомендации в связи со вспышкой нового коронавируса в 2019 г. – США, 31 декабря 2019 г. – 4 февраля 2020 г. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020; 69: 140.
  12. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Временное руководство по сбору, обработке и тестированию клинических образцов от лиц, находящихся под следствием (PUI), на коронавирусную болезнь 2019 (COVID-19). https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/guidelines-clinical-specimens.html (по состоянию на 30 апреля 2020 г.).
  13. He X, Lau EHY, Wu P и др. Временная динамика распространения вируса и трансмиссивности COVID-19. Nat Med 2020; 26: 672.
  14. Вельфель Р., Корман В.М., Гуггемос В. и др. Вирусологическая оценка госпитализированных пациентов с COVID-2019. Природа 2020; 581: 465.
  15. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Симптомно-ориентированная стратегия прекращения изоляции для людей с COVID-19: Памятка для принятия решения. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/strategy-discontinue-isolation.html (последнее посещение – 4 мая 2020 г.).
  16. Всемирная организация здравоохранения. Техническое руководство по коронавирусной болезни (COVID-19): эпиднадзор и определения случаев. https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/surveillance-and-case-definitions (по состоянию на 28 февраля 2020 г.).
  17. Caturegli G, Materi J, Howard BM, Caturegli P. Клиническая валидность сывороточных антител к SARS-CoV-2: исследование случай-контроль. Ann Intern Med 2020.
  18. Hansen KE, Caliendo AM, Arias CA и др. Руководство Американского общества инфекционистов по диагностике COVID-19: серологическое тестирование. 18 августа 2020 г. https://www.idsociety.org/practice-guideline/covid-19-guideline-serology/ (по состоянию на 19 августа 2020 г.).
  19. Wu X, Cai Y, Huang X и др. Коинфекция SARS-CoV-2 и вирусом гриппа A у пациента с пневмонией, Китай. Emerg Infect Dis 2020; 26: 1324.
  20. Дин Кью, Лу П, Фань И и др. Клинические характеристики пациентов с пневмонией, коинфицированных новым коронавирусом 2019 года и вирусом гриппа, в Ухане, Китай. J Med Virol 2020.
  21. Ким Д., Куинн Дж., Пински Б. и др. Уровни коинфекции между SARS-CoV-2 и другими респираторными патогенами. JAMA 2020.
  22. Ричардсон С., Хирш Дж. С., Нарасимхан М. и др. Представление характеристик, сопутствующих заболеваний и результатов у 5700 пациентов, госпитализированных с COVID-19 в районе Нью-Йорка. JAMA 2020.
  23. Фанг ФК, Наккаш С.Н., Гренингер А.Л. Лабораторная диагностика COVID-19 – часто задаваемые вопросы. Clin Infect Dis 2020.
  24. Всемирная организация здравоохранения. Лабораторное тестирование на новый коронавирус 2019 года (2019-nCoV) с подозрением на случаи заболевания людей. https://www.who.int/publications-detail/laboratory-testing-for-2019-novel-coronavirus-in-suspected-human-cases-20200117 (по состоянию на 22 апреля 2020 г.).
  25. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. Разрешения на использование в чрезвычайных ситуациях. https://www.fda.gov/medical-devices/emergency-situations-medical-devices/emergency-use-authorizations (по состоянию на 16 апреля 2020 г.).
  26. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-test-patient-home-sample-collection (по состоянию на 22 апреля 2020 г.).
  27. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-standalone-home-sample-collection-kit-can-be-used (доступно на 18 мая 2020 г.).
  28. Hogan CA, Sahoo MK, Pinsky BA. Сбор образцов как стратегия обнаружения передачи SARS-CoV-2 в сообществе. JAMA 2020.
  29. Елин И., Ахарони Н., Шаер Тамар Е. и др. Оценка теста COVID-19 RT-qPCR в пулах с несколькими образцами. Clin Infect Dis 2020.
  30. Abdalhamid B, Bilder CR, McCutchen EL, et al. Оценка объединения образцов для сохранения ресурсов для тестирования SARS CoV-2. Am J Clin Pathol 2020; 153: 715.
  31. Пилчер CD, Westreich D, Hudgens MG. Групповое тестирование на тяжелый острый респираторный синдром – коронавирус 2 для быстрого расширения масштабов тестирования и наблюдения за заболеваемостью в режиме реального времени. J Infect Dis 2020; 222: 903.
  32. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. Обновление по коронавирусу (COVID-19): FDA информирует общественность о возможных сомнениях в точности результатов теста Abbott ID NOW в точке оказания помощи https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update -fda-informs-public-about-possible-precision-issues-abbott-id-now-point (по состоянию на 19 мая 2020 г.).
  33. Налла А.К., Касто А.М., Хуанг М.В. и др. Сравнительная эффективность анализов обнаружения SARS-CoV-2 с использованием семи различных наборов праймер-зондов и одного набора для анализа. J Clin Microbiol 2020; 58.
  34. Либерман Дж. А., Пеппер Дж., Наккаш С. Н. и др. Сравнение коммерчески доступных и разработанных в лаборатории тестов для обнаружения in vitro SARS-CoV-2 в клинических лабораториях. J Clin Microbiol 2020; 58.
  35. Ложноположительные результаты с реагентами BD SARS-CoV-2 для системы BD Max – письмо персоналу клинической лаборатории и медицинским работникам. https://www.fda.gov/medical-devices/letters-health-care-providers/false-positive-results-bd-sars-cov-2-reagents-bd-max-system-letter-clinical-laboratory- Staff-and (дата обращения 10 июля 2020 г.).
  36. Weissleder R, Lee H, Ko J, Pittet MJ. Диагностика COVID-19 в контексте. Sci Transl Med 2020; 12.
  37. Long DR, Gombar S, Hogan CA и др. Возникновение и время последующей положительной ОТ-ПЦР на SARS-CoV-2 у первоначально отрицательных пациентов. Clin Infect Dis 2020.
  38. Fang Y, Zhang H, Xie J и др. Чувствительность КТ грудной клетки на COVID-19: сравнение с ОТ-ПЦР. Радиология 2020; 296: E115.
  39. Ли TH, Лин RJ, Лин RTP и др. Тестирование на SARS-CoV-2: можем ли мы остановиться на двух? Clin Infect Dis 2020.
  40. Ван В., Сюй И, Гао Р. и др. Обнаружение SARS-CoV-2 в различных типах клинических образцов. JAMA 2020.
  41. Ю Ф, Ян Л., Ван Н. и др. Количественное определение и анализ вирусной нагрузки SARS-CoV-2 у инфицированных пациентов. Clin Infect Dis 2020; 71: 793.
  42. Группа по расследованию COVID-19. Клинические и вирусологические характеристики первых 12 пациентов с коронавирусной болезнью 2019 г. (COVID-19) в США. Nat Med 2020; 26: 861.
  43. Ту Ю.П., Дженнингс Р., Харт Б. и др. Мазки, собранные пациентами или медицинскими работниками для тестирования на SARS-CoV-2. N Engl J Med 2020; 383: 494.
  44. McCulloch DJ, Kim AE, Wilcox NC и др. Сравнение взятых самостоятельно в домашних условиях мазков из носа без присмотра с мазками из носоглотки для выявления инфекции SARS-CoV-2. JAMA Netw Open 2020; 3: e2016382.
  45. Cheuk S, Wong Y, Tse H, et al. Задняя ротоглоточная слюна для обнаружения SARS-CoV-2. Clin Infect Dis 2020.
  46. Джамал А.Дж., Мозафарихашин М., Кумес Э. и др. Чувствительность мазков из носоглотки и слюны для выявления тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2). Clin Infect Dis 2020.
  47. Pasomsub E, Watcharananan SP, Boonyawat K и др. Образец слюны как неинвазивный образец для диагностики коронавирусной болезни 2019: кросс-секционное исследование. Clin Microbiol Infect 2020.
  48. Уильямс Э., Бонд К., Чжан Б. и др. Слюна как неинвазивный образец для обнаружения SARS-CoV-2. J Clin Microbiol 2020; 58.
  49. Рао М., Рашид Ф.А., Сабри ФСАХ и др. Сравнение мазка из носоглотки и ранней утренней слюны для выявления SARS-CoV-2. Clin Infect Dis 2020.
  50. Отто М.П., ​​Дарлес С., Валеро Э. и др. Задняя ротоглоточная слюна для обнаружения SARS-CoV-2. Clin Infect Dis 2020.
  51. Куцирка Л.М., Лауэр С.А., Лейендекер О. и др. Изменение частоты ложноотрицательных результатов тестов SARS-CoV-2 на основе полимеразной цепной реакции с обратной транскриптазой в зависимости от времени после контакта. Ann Intern Med 2020; 173: 262.
  52. Го Л., Рен Л., Ян С. и др. Профилирование раннего гуморального ответа на диагностику нового коронавирусного заболевания (COVID-19). Clin Infect Dis 2020; 71: 778.
  53. Фурукава Н.В., Брукс Дж. Т., Собел Дж. Доказательства, подтверждающие передачу тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 в предсимптомном или бессимптомном состоянии. Emerg Infect Dis 2020; 26.
  54. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Временное руководство по быстрому тестированию на антиген SARS-CoV-2. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/resources/antigen-tests-guidelines.html?deliveryName=USCDC_2067-DM35559#table2 (по состоянию на 17 августа 2020 г.).
  55. Палтиэль А.Д., Чжэн А., Валенский Р.П. Оценка стратегий скрининга SARS-CoV-2 для обеспечения безопасного повторного открытия кампусов колледжей в США. JAMA Netw Open 2020; 3: e2016818.
  56. Заявление Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США: Обновление по коронавирусу (COVID-19): FDA санкционирует первый тест на антиген, который поможет в быстром обнаружении вируса, вызывающего COVID-19 у пациентов. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-antigen-test-help-rapid-detection-virus-causes (по состоянию на 12 мая. , 2020).
  57. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Временные рекомендации по тестированию на антитела к COVID-19 в клинических условиях и в системе общественного здравоохранения https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/resources/antibody-tests-guidelines.html?deliveryName=USCDC_2067-DM29085 (Доступно на 26 мая 2020 г.).
  58. Ченг М.П., ​​Янсуни С.П., Баста Н.Е. и др. Серодиагностика тяжелого острого респираторного синдрома, связанного с коронавирусом-2: обзорный обзор. Ann Intern Med 2020.
  59. Брайант Дж. Э., Азман А. С., Феррари М. Дж. И др. Серология SARS-CoV-2: опасения, возможности и путь вперед. Sci Immunol 2020; 5.
  60. Чжао Дж., Юань Ц., Ван Х и др. Ответы антител на SARS-CoV-2 у пациентов с новым коронавирусным заболеванием 2019 г. Clin Infect Dis 2020.
  61. Цюй Дж., Ву Ц., Ли Х и др. Профиль антител IgG и IgM к коронавирусу 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2). Clin Infect Dis 2020.
  62. Zhang G, Nie S, Zhang Z, Zhang Z. Продольное изменение антител к коронавирусу 2 тяжелого острого респираторного синдрома у пациентов с коронавирусным заболеванием 2019. J Infect Dis 2020; 222: 183.
  63. Дикс Дж. Дж., Диннес Дж., Таквоинги Ю. и др. Тесты на антитела для выявления текущей и прошлой инфекции SARS-CoV-2. Кокрановская база данных Syst Rev 2020; 6: CD013652.
  64. Long QX, Liu BZ, Deng HJ и др. Ответы антител на SARS-CoV-2 у пациентов с COVID-19. Nat Med 2020; 26: 845.
  65. Ван X, Гуо X, Синь Q и др. Нейтрализующие реакции антител на SARS-CoV-2 у стационарных и выздоравливающих пациентов с COVID-19. Clin Infect Dis 2020.
  66. Лисбоа Бастос М., Тавазива Г., Абиди С.К. и др. Диагностическая точность серологических тестов на covid-19: систематический обзор и метаанализ. BMJ 2020; 370: m2516.
  67. Лустиг Ю., Келер С., Колодный Р. и др. Возможная антигенная перекрестная реактивность между вирусами SARS-CoV-2 и денге. Clin Infect Dis 2020.
  68. Long QX, Tang XJ, Shi QL и др. Клинико-иммунологическая оценка бессимптомных инфекций SARS-CoV-2. Nat Med 2020; 26: 1200.
  69. Ибаррондо Ф. Дж., Фулчер Дж. А., Гудман-Меза Д. и др. Быстрый распад антител против SARS-CoV-2 у людей с умеренным Covid-19. N Engl J Med 2020.
  70. Буллард Дж., Даст К., Функ Д. и др. Прогнозирование инфекционного SARS-CoV-2 на основе диагностических образцов. Clin Infect Dis 2020.
  71. Лю В.Д., Чанг С.Ю., Ван Дж. Т. и др. Продолжительное выделение вируса даже после сероконверсии у пациента с COVID-19. J Infect 2020; 81: 318.
  72. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Клинические вопросы о COVID-19: вопросы и ответы. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html (по состоянию на 14 августа 2020 г.).